生物知识

环境微生物DNA提取方法的突破

作者:admin 来源:丁香通 发布时间: 2014-09-21 22:11  浏览次数:
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农药、除草剂、各种污染物、人工合成物等异生物质,对环境和土壤微生物的多样性、种群变化产生明显影响;转基因作物是否发生土壤基因转移的检测,转基因作物的安全性评价等方面的研究,都需要准确的提取高质量的DNA进行检测。
土壤中可培养的微生物可能不及所有微生物总数的0.3%,常规提取DNA的方法很难提取到DNA,很难把土壤中的腐殖酸去除干净,而微量的腐殖酸就可能导致PCR失败。
目前国际上商用的试剂盒虽然能提取到土壤中微生物的DNA,但由于破碎方法采用玻璃珠或者钢珠破碎,导致基因组断裂严重,影响DNA质量;第二,由于必须购买破碎专用的破碎机或振荡器,增加其使用成本;第三,其试剂盒为了保证DNA纯度,采用了包括玻璃奶、离心吸附柱串联的纯化方式,导致了DNA大量的损失,得率很低,很难真正反映出土壤中微生物的多样性。百泰克推出的土壤基因组DNA快速提取试剂盒(DP4001)采用创新技术,摒弃了机械破碎细胞的方法,采用酶法破碎,保证了基因组的完整性,摒弃了玻璃奶、离心吸附柱串联纯化DNA的方式,极大的提高了DNA的得率,几乎土壤中所有的微生物DNA都能提取出来,能真正反映土壤中微生物的多样性。

产品名
基因组裂解方法
纯化得率
实验设备
BioTeke Soil Genomic DNA Rapid Extraction Kit
酶法破碎基因组完整 特制纯化柱得率纯度高 时间1小时内不需要特殊设备
FastDNA® SPIN Kit 钢珠破碎基因组断裂 玻璃奶离心吸附柱纯化得率低 时间2小时需要专门破碎设备
UltraClean™ Soil DNA Isolation Kit 玻璃珠破碎基因组断裂 离心吸附柱纯化得率低 时间2小时需要专门震荡器

玻璃奶纯化得率60-75% ,离心吸附柱纯化得率60-80% ,百泰克的产品因为不使用玻璃奶和离心吸附柱纯化,直接用异丙醇沉淀,能极大的避免DNA的损失。

 

FastDNA® SPIN Kit for Soil网址链接http://www.bitebo.com/a/gb2312/yiqi/MP%20Bio/2012/0802/4857.html

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