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土壤微生物分子生态技术服务

作者:admin 来源: 发布时间: 2012-12-27 17:58  浏览次数:
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土壤微生物分子生态技术服务 

1.     土壤理化性质测定
测定土壤全量和有效C、N、P、K等土壤营养元素含量。
2.     荧光底物土壤酶活性测定
按(Saiya-Cork et al. 2002) 的方法,采用荧光底物测定土壤中UreaseAcid phosphataseβ-glucosidaseα-glucosidaseCellobiohydrolaseβ-xylosidase等酶活性。
3.     PLFA群落分析
采用美国MIDI公司的Sherlock群落分析软件研究土壤微生物群落的PLFA指纹图谱。分析土壤微生物群落结构,进行PCA和RDA等多变量分析,建立与土壤性质和功能的联系。
4.     变性梯度凝胶电泳(DGGE)
按(Muyzer et al. 1993)的原理,制作细菌(16S)、真菌(18SITS)、氨氧化细菌和古菌(amoA)、甲烷氧化菌(pmoA)等土壤微生物的变性梯度电泳图,分析土壤微生物群落结构,进行PCARDA等多变量分析,建立与土壤性质和功能的联系。
5.     末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)
按(Liu et al. 1997)的原理,分析细菌(16S)、真菌(18SITS)、氨氧化细菌和古菌(amoA)、甲烷氧化菌(pmoA)等土壤微生物的酶切片段多态性,分析群落结构,进行PCARDA等多变量分析,建立与土壤性质和功能的联系。
6.     实时荧光定量pcr(Real-time PCR)
7.     稳定同位素探针技术(SIP)
按(Neufeld et al. 2007)的方法,研究同化13C-15N-底物(如13C-glucose15N-Urea等)的活性功能微生物。
 
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张坤烽,电话:13426363914010-82015225,邮箱:sales@bitebo.com
 
参考文献
1.       Liu W T, Marsh T L, Cheng H and Forney L J 1997 Characterization of microbial diversity by determining terminal restriction fragment length polymorphisms of genes encoding 16S rRNA. Applied and environmental microbiology 63, 4516-4522.
2.       Muyzer G, De Waal E C and Uitterlinden A G 1993 Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA. Applied and environmental microbiology 59, 695-700.
3.       Neufeld J D, Vohra J, Dumont M G, Lueders T, Manefield M, Friedrich M W and Murrell J C 2007 DNA stable-isotope probing. Nature protocols 2, 860-866.
4.       Saiya-Cork K R, Sinsabaugh R L and Zak D R 2002 The effects of long term nitrogen deposition on extracellular enzyme activity in an Acer saccharum forest soil. Soil Biology and Biochemistry 34, 1309-1315.
 

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